Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PapolbQ9WVP6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PapolbQ9WVP6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PapolbQ9WVP6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PapolbQ9WVP6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PapolbQ9WVP6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PapolbQ9WVP6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PapolbQ9WVP6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PapolbQ9WVP6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PapolbQ9WVP6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PapolbQ9WVP6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PapolbQ9WVP6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PapolbQ9WVP6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PapolbQ9WVP6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PapolbQ9WVP6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PapolbQ9WVP6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PapolbQ9WVP6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PapolbQ9WVP6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PapolbQ9WVP6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PapolbQ9WVP6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PapolbQ9WVP6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PapolbQ9WVP6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PapolbQ9WVP6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PapolbQ9WVP6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PapolbQ9WVP6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PapolbQ9WVP6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms