Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cul1Q9WTX6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cul1Q9WTX6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul1Q9WTX6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cul1Q9WTX6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul1Q9WTX6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul1Q9WTX6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul1Q9WTX6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cul1Q9WTX6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul1Q9WTX6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul1Q9WTX6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul1Q9WTX6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul1Q9WTX6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul1Q9WTX6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul1Q9WTX6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul1Q9WTX6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul1Q9WTX6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul1Q9WTX6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul1Q9WTX6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul1Q9WTX6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul1Q9WTX6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul1Q9WTX6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cul1Q9WTX6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms