Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sema6cQ9WTM3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema6cQ9WTM3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema6cQ9WTM3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6cQ9WTM3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6cQ9WTM3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6cQ9WTM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms