Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cry2Q9R194 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cry2Q9R194 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cry2Q9R194 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cry2Q9R194 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cry2Q9R194 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cry2Q9R194 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cry2Q9R194 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cry2Q9R194 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cry2Q9R194 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cry2Q9R194 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cry2Q9R194 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cry2Q9R194 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Cry2Q9R194 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cry2Q9R194 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cry2Q9R194 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cry2Q9R194 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cry2Q9R194 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cry2Q9R194 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cry2Q9R194 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cry2Q9R194 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cry2Q9R194 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cry2Q9R194 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cry2Q9R194 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cry2Q9R194 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cry2Q9R194 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cry2Q9R194 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cry2Q9R194 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cry2Q9R194 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cry2Q9R194 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cry2Q9R194 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cry2Q9R194 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cry2Q9R194 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cry2Q9R194 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cry2Q9R194 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cry2Q9R194 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cry2Q9R194 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cry2Q9R194 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cry2Q9R194 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cry2Q9R194 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cry2Q9R194 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cry2Q9R194 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cry2Q9R194 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cry2Q9R194 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cry2Q9R194 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cry2Q9R194 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cry2Q9R194 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cry2Q9R194 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cry2Q9R194 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cry2Q9R194 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cry2Q9R194 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cry2Q9R194 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cry2Q9R194 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cry2Q9R194 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cry2Q9R194 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cry2Q9R194 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cry2Q9R194 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cry2Q9R194 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cry2Q9R194 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cry2Q9R194 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cry2Q9R194 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cry2Q9R194 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cry2Q9R194 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cry2Q9R194 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cry2Q9R194 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms