Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrg1Q9R0Y8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrg1Q9R0Y8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabrg1Q9R0Y8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrg1Q9R0Y8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabrg1Q9R0Y8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabrg1Q9R0Y8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabrg1Q9R0Y8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabrg1Q9R0Y8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabrg1Q9R0Y8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabrg1Q9R0Y8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrg1Q9R0Y8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabrg1Q9R0Y8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabrg1Q9R0Y8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabrg1Q9R0Y8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabrg1Q9R0Y8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabrg1Q9R0Y8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabrg1Q9R0Y8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabrg1Q9R0Y8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabrg1Q9R0Y8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrg1Q9R0Y8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabrg1Q9R0Y8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabrg1Q9R0Y8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrg1Q9R0Y8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabrg1Q9R0Y8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gabrg1Q9R0Y8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabrg1Q9R0Y8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabrg1Q9R0Y8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabrg1Q9R0Y8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabrg1Q9R0Y8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms