Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt9Q9R0N9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syt9Q9R0N9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syt9Q9R0N9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt9Q9R0N9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt9Q9R0N9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syt9Q9R0N9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt9Q9R0N9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syt9Q9R0N9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt9Q9R0N9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt9Q9R0N9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syt9Q9R0N9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syt9Q9R0N9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms