Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Plod2Q9R0B9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Plod2Q9R0B9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plod2Q9R0B9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plod2Q9R0B9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plod2Q9R0B9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plod2Q9R0B9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plod2Q9R0B9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plod2Q9R0B9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod2Q9R0B9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plod2Q9R0B9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Plod2Q9R0B9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod2Q9R0B9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plod2Q9R0B9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms