Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cbx8Q9QXV1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cbx8Q9QXV1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cbx8Q9QXV1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cbx8Q9QXV1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cbx8Q9QXV1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cbx8Q9QXV1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cbx8Q9QXV1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cbx8Q9QXV1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cbx8Q9QXV1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbx8Q9QXV1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cbx8Q9QXV1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cbx8Q9QXV1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cbx8Q9QXV1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cbx8Q9QXV1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cbx8Q9QXV1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cbx8Q9QXV1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cbx8Q9QXV1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cbx8Q9QXV1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx8Q9QXV1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cbx8Q9QXV1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cbx8Q9QXV1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms