Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phc2Q9QWH1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Phc2Q9QWH1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Phc2Q9QWH1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phc2Q9QWH1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phc2Q9QWH1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phc2Q9QWH1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phc2Q9QWH1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phc2Q9QWH1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phc2Q9QWH1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phc2Q9QWH1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phc2Q9QWH1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phc2Q9QWH1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phc2Q9QWH1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phc2Q9QWH1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Phc2Q9QWH1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Phc2Q9QWH1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phc2Q9QWH1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms