Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cabp1Q9JLK7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cabp1Q9JLK7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cabp1Q9JLK7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Cabp1Q9JLK7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Cabp1Q9JLK7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Cabp1Q9JLK7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Cabp1Q9JLK7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Cabp1Q9JLK7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Cabp1Q9JLK7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Cabp1Q9JLK7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Cabp1Q9JLK7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cabp1Q9JLK7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cabp1Q9JLK7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cabp1Q9JLK7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cabp1Q9JLK7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cabp1Q9JLK7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cabp1Q9JLK7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Cabp1Q9JLK7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cabp1Q9JLK7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cabp1Q9JLK7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cabp1Q9JLK7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cabp1Q9JLK7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cabp1Q9JLK7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Cabp1Q9JLK7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cabp1Q9JLK7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cabp1Q9JLK7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Cabp1Q9JLK7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cabp1Q9JLK7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Cabp1Q9JLK7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cabp1Q9JLK7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Cabp1Q9JLK7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Cabp1Q9JLK7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cabp1Q9JLK7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cabp1Q9JLK7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Cabp1Q9JLK7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cabp1Q9JLK7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cabp1Q9JLK7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Cabp1Q9JLK7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Cabp1Q9JLK7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cabp1Q9JLK7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Cabp1Q9JLK7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cabp1Q9JLK7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cabp1Q9JLK7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Cabp1Q9JLK7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cabp1Q9JLK7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Cabp1Q9JLK7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cabp1Q9JLK7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Cabp1Q9JLK7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Cabp1Q9JLK7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Cabp1Q9JLK7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cabp1Q9JLK7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cabp1Q9JLK7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cabp1Q9JLK7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cabp1Q9JLK7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cabp1Q9JLK7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cabp1Q9JLK7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cabp1Q9JLK7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cabp1Q9JLK7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cabp1Q9JLK7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cabp1Q9JLK7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cabp1Q9JLK7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cabp1Q9JLK7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cabp1Q9JLK7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cabp1Q9JLK7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cabp1Q9JLK7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cabp1Q9JLK7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cabp1Q9JLK7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cabp1Q9JLK7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cabp1Q9JLK7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cabp1Q9JLK7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cabp1Q9JLK7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cabp1Q9JLK7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cabp1Q9JLK7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Cabp1Q9JLK7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cabp1Q9JLK7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cabp1Q9JLK7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cabp1Q9JLK7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cabp1Q9JLK7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cabp1Q9JLK7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Cabp1Q9JLK7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cabp1Q9JLK7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cabp1Q9JLK7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Cabp1Q9JLK7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cabp1Q9JLK7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cabp1Q9JLK7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cabp1Q9JLK7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cabp1Q9JLK7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cabp1Q9JLK7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms