Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tgm1Q9JLF6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tgm1Q9JLF6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tgm1Q9JLF6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tgm1Q9JLF6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tgm1Q9JLF6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tgm1Q9JLF6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tgm1Q9JLF6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm1Q9JLF6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms