Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Tmod2Q9JKK7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tmod2Q9JKK7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tmod2Q9JKK7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tmod2Q9JKK7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmod2Q9JKK7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmod2Q9JKK7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tmod2Q9JKK7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tmod2Q9JKK7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tmod2Q9JKK7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Tmod2Q9JKK7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmod2Q9JKK7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmod2Q9JKK7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmod2Q9JKK7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmod2Q9JKK7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tmod2Q9JKK7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tmod2Q9JKK7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tmod2Q9JKK7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tmod2Q9JKK7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tmod2Q9JKK7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmod2Q9JKK7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmod2Q9JKK7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmod2Q9JKK7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmod2Q9JKK7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tmod2Q9JKK7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmod2Q9JKK7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmod2Q9JKK7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmod2Q9JKK7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tmod2Q9JKK7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmod2Q9JKK7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmod2Q9JKK7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tmod2Q9JKK7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tmod2Q9JKK7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tmod2Q9JKK7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tmod2Q9JKK7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmod2Q9JKK7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tmod2Q9JKK7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmod2Q9JKK7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmod2Q9JKK7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tmod2Q9JKK7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmod2Q9JKK7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmod2Q9JKK7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmod2Q9JKK7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tmod2Q9JKK7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmod2Q9JKK7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmod2Q9JKK7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tmod2Q9JKK7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tmod2Q9JKK7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmod2Q9JKK7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tmod2Q9JKK7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmod2Q9JKK7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmod2Q9JKK7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmod2Q9JKK7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tmod2Q9JKK7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmod2Q9JKK7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmod2Q9JKK7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmod2Q9JKK7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tmod2Q9JKK7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tmod2Q9JKK7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tmod2Q9JKK7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tmod2Q9JKK7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tmod2Q9JKK7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmod2Q9JKK7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tmod2Q9JKK7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmod2Q9JKK7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmod2Q9JKK7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmod2Q9JKK7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmod2Q9JKK7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmod2Q9JKK7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmod2Q9JKK7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmod2Q9JKK7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tmod2Q9JKK7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmod2Q9JKK7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tmod2Q9JKK7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms