Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alyref2Q9JJW6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Alyref2Q9JJW6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alyref2Q9JJW6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Alyref2Q9JJW6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Alyref2Q9JJW6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Alyref2Q9JJW6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Alyref2Q9JJW6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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