Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smad9Q9JIW5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad9Q9JIW5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smad9Q9JIW5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smad9Q9JIW5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smad9Q9JIW5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smad9Q9JIW5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smad9Q9JIW5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smad9Q9JIW5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smad9Q9JIW5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad9Q9JIW5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad9Q9JIW5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad9Q9JIW5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smad9Q9JIW5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad9Q9JIW5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smad9Q9JIW5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smad9Q9JIW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smad9Q9JIW5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Smad9Q9JIW5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smad9Q9JIW5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smad9Q9JIW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smad9Q9JIW5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad9Q9JIW5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smad9Q9JIW5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smad9Q9JIW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms