Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclre1aQ9JIC3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclre1aQ9JIC3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclre1aQ9JIC3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclre1aQ9JIC3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclre1aQ9JIC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclre1aQ9JIC3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclre1aQ9JIC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclre1aQ9JIC3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclre1aQ9JIC3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclre1aQ9JIC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dclre1aQ9JIC3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dclre1aQ9JIC3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Dclre1aQ9JIC3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Dclre1aQ9JIC3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms