Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
OtofQ9ESF1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OtofQ9ESF1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OtofQ9ESF1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OtofQ9ESF1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
OtofQ9ESF1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OtofQ9ESF1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
OtofQ9ESF1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OtofQ9ESF1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
OtofQ9ESF1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OtofQ9ESF1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OtofQ9ESF1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
OtofQ9ESF1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
OtofQ9ESF1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OtofQ9ESF1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OtofQ9ESF1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OtofQ9ESF1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OtofQ9ESF1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OtofQ9ESF1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
OtofQ9ESF1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OtofQ9ESF1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
OtofQ9ESF1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OtofQ9ESF1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OtofQ9ESF1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OtofQ9ESF1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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