Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aff4Q9ESC8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aff4Q9ESC8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aff4Q9ESC8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms