Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aff4Q9ESC8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aff4Q9ESC8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aff4Q9ESC8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Aff4Q9ESC8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aff4Q9ESC8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aff4Q9ESC8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aff4Q9ESC8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aff4Q9ESC8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aff4Q9ESC8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aff4Q9ESC8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
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