Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ms4a4bQ9ES61 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ms4a4bQ9ES61 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ms4a4bQ9ES61 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ms4a4bQ9ES61 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ms4a4bQ9ES61 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ms4a4bQ9ES61 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ms4a4bQ9ES61 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ms4a4bQ9ES61 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ms4a4bQ9ES61 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ms4a4bQ9ES61 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ms4a4bQ9ES61 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ms4a4bQ9ES61 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ms4a4bQ9ES61 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms