Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc4Q9ES56 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc4Q9ES56 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc4Q9ES56 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc4Q9ES56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc4Q9ES56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc4Q9ES56 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc4Q9ES56 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc4Q9ES56 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc4Q9ES56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc4Q9ES56 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc4Q9ES56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc4Q9ES56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trappc4Q9ES56 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trappc4Q9ES56 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trappc4Q9ES56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trappc4Q9ES56 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms