Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ParvbQ9ES46 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ParvbQ9ES46 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ParvbQ9ES46 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ParvbQ9ES46 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ParvbQ9ES46 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ParvbQ9ES46 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ParvbQ9ES46 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ParvbQ9ES46 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ParvbQ9ES46 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ParvbQ9ES46 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ParvbQ9ES46 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ParvbQ9ES46 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ParvbQ9ES46 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ParvbQ9ES46 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ParvbQ9ES46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ParvbQ9ES46 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ParvbQ9ES46 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ParvbQ9ES46 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ParvbQ9ES46 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ParvbQ9ES46 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ParvbQ9ES46 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms