Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER41

Tor1b, Torsin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1bQ9ER41 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tor1bQ9ER41 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tor1bQ9ER41 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tor1bQ9ER41 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Tor1bQ9ER41 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tor1bQ9ER41 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tor1bQ9ER41 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tor1bQ9ER41 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tor1bQ9ER41 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tor1bQ9ER41 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tor1bQ9ER41 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tor1bQ9ER41 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tor1bQ9ER41 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tor1bQ9ER41 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tor1bQ9ER41 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tor1bQ9ER41 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tor1bQ9ER41 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tor1bQ9ER41 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tor1bQ9ER41 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tor1bQ9ER41 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tor1bQ9ER41 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tor1bQ9ER41 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tor1bQ9ER41 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tor1bQ9ER41 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tor1bQ9ER41 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms