Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cpsf1Q9EPU4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cpsf1Q9EPU4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cpsf1Q9EPU4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cpsf1Q9EPU4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cpsf1Q9EPU4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cpsf1Q9EPU4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cpsf1Q9EPU4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cpsf1Q9EPU4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cpsf1Q9EPU4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cpsf1Q9EPU4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cpsf1Q9EPU4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cpsf1Q9EPU4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Cpsf1Q9EPU4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cpsf1Q9EPU4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cpsf1Q9EPU4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cpsf1Q9EPU4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cpsf1Q9EPU4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cpsf1Q9EPU4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cpsf1Q9EPU4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Cpsf1Q9EPU4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cpsf1Q9EPU4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cpsf1Q9EPU4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cpsf1Q9EPU4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cpsf1Q9EPU4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cpsf1Q9EPU4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cpsf1Q9EPU4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cpsf1Q9EPU4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cpsf1Q9EPU4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cpsf1Q9EPU4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cpsf1Q9EPU4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cpsf1Q9EPU4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cpsf1Q9EPU4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cpsf1Q9EPU4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cpsf1Q9EPU4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cpsf1Q9EPU4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cpsf1Q9EPU4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cpsf1Q9EPU4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cpsf1Q9EPU4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cpsf1Q9EPU4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cpsf1Q9EPU4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cpsf1Q9EPU4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cpsf1Q9EPU4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cpsf1Q9EPU4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cpsf1Q9EPU4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cpsf1Q9EPU4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Cpsf1Q9EPU4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Cpsf1Q9EPU4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cpsf1Q9EPU4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cpsf1Q9EPU4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cpsf1Q9EPU4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cpsf1Q9EPU4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cpsf1Q9EPU4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cpsf1Q9EPU4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cpsf1Q9EPU4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Cpsf1Q9EPU4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Cpsf1Q9EPU4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cpsf1Q9EPU4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cpsf1Q9EPU4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cpsf1Q9EPU4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Cpsf1Q9EPU4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cpsf1Q9EPU4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cpsf1Q9EPU4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cpsf1Q9EPU4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Cpsf1Q9EPU4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Cpsf1Q9EPU4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Cpsf1Q9EPU4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Cpsf1Q9EPU4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cpsf1Q9EPU4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cpsf1Q9EPU4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cpsf1Q9EPU4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cpsf1Q9EPU4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Cpsf1Q9EPU4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cpsf1Q9EPU4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Cpsf1Q9EPU4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cpsf1Q9EPU4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cpsf1Q9EPU4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cpsf1Q9EPU4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Cpsf1Q9EPU4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Cpsf1Q9EPU4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Cpsf1Q9EPU4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Cpsf1Q9EPU4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Cpsf1Q9EPU4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Cpsf1Q9EPU4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cpsf1Q9EPU4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Cpsf1Q9EPU4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Cpsf1Q9EPU4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Cpsf1Q9EPU4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cpsf1Q9EPU4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cpsf1Q9EPU4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Cpsf1Q9EPU4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cpsf1Q9EPU4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Cpsf1Q9EPU4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cpsf1Q9EPU4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Cpsf1Q9EPU4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cpsf1Q9EPU4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Cpsf1Q9EPU4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms