Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPC5

Rbp7, Retinoid-binding protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp7Q9EPC5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbp7Q9EPC5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbp7Q9EPC5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbp7Q9EPC5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbp7Q9EPC5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbp7Q9EPC5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbp7Q9EPC5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbp7Q9EPC5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbp7Q9EPC5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbp7Q9EPC5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rbp7Q9EPC5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbp7Q9EPC5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbp7Q9EPC5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbp7Q9EPC5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbp7Q9EPC5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbp7Q9EPC5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbp7Q9EPC5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbp7Q9EPC5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbp7Q9EPC5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbp7Q9EPC5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbp7Q9EPC5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbp7Q9EPC5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbp7Q9EPC5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbp7Q9EPC5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbp7Q9EPC5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbp7Q9EPC5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbp7Q9EPC5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbp7Q9EPC5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rbp7Q9EPC5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rbp7Q9EPC5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rbp7Q9EPC5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbp7Q9EPC5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rbp7Q9EPC5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbp7Q9EPC5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbp7Q9EPC5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbp7Q9EPC5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rbp7Q9EPC5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbp7Q9EPC5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rbp7Q9EPC5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rbp7Q9EPC5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbp7Q9EPC5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbp7Q9EPC5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbp7Q9EPC5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rbp7Q9EPC5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rbp7Q9EPC5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbp7Q9EPC5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbp7Q9EPC5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rbp7Q9EPC5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rbp7Q9EPC5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rbp7Q9EPC5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rbp7Q9EPC5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rbp7Q9EPC5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rbp7Q9EPC5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rbp7Q9EPC5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rbp7Q9EPC5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbp7Q9EPC5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbp7Q9EPC5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbp7Q9EPC5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbp7Q9EPC5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbp7Q9EPC5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbp7Q9EPC5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbp7Q9EPC5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbp7Q9EPC5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbp7Q9EPC5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbp7Q9EPC5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbp7Q9EPC5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbp7Q9EPC5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 903.5 ms