Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc38a3Q9DCP2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc38a3Q9DCP2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc38a3Q9DCP2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc38a3Q9DCP2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc38a3Q9DCP2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc38a3Q9DCP2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc38a3Q9DCP2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slc38a3Q9DCP2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc38a3Q9DCP2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc38a3Q9DCP2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc38a3Q9DCP2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc38a3Q9DCP2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms