Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
1700018B08RikQ9DA83 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
1700018B08RikQ9DA83 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
1700018B08RikQ9DA83 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
1700018B08RikQ9DA83 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
1700018B08RikQ9DA83 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
1700018B08RikQ9DA83 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
1700018B08RikQ9DA83 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
1700018B08RikQ9DA83 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
1700018B08RikQ9DA83 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
1700018B08RikQ9DA83 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
1700018B08RikQ9DA83 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
1700018B08RikQ9DA83 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
1700018B08RikQ9DA83 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
1700018B08RikQ9DA83 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
1700018B08RikQ9DA83 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
1700018B08RikQ9DA83 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
1700018B08RikQ9DA83 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
1700018B08RikQ9DA83 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
1700018B08RikQ9DA83 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
1700018B08RikQ9DA83 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
1700018B08RikQ9DA83 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
1700018B08RikQ9DA83 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
1700018B08RikQ9DA83 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
1700018B08RikQ9DA83 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
1700018B08RikQ9DA83 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700018B08RikQ9DA83 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
1700018B08RikQ9DA83 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
1700018B08RikQ9DA83 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
1700018B08RikQ9DA83 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
1700018B08RikQ9DA83 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
1700018B08RikQ9DA83 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
1700018B08RikQ9DA83 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
1700018B08RikQ9DA83 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
1700018B08RikQ9DA83 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
1700018B08RikQ9DA83 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
1700018B08RikQ9DA83 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
1700018B08RikQ9DA83 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
1700018B08RikQ9DA83 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
1700018B08RikQ9DA83 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
1700018B08RikQ9DA83 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
1700018B08RikQ9DA83 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
1700018B08RikQ9DA83 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700018B08RikQ9DA83 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
1700018B08RikQ9DA83 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
1700018B08RikQ9DA83 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700018B08RikQ9DA83 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700018B08RikQ9DA83 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700018B08RikQ9DA83 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700018B08RikQ9DA83 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
1700018B08RikQ9DA83 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
1700018B08RikQ9DA83 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
1700018B08RikQ9DA83 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
1700018B08RikQ9DA83 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700018B08RikQ9DA83 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
1700018B08RikQ9DA83 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700018B08RikQ9DA83 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
1700018B08RikQ9DA83 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1700018B08RikQ9DA83 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
1700018B08RikQ9DA83 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
1700018B08RikQ9DA83 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
1700018B08RikQ9DA83 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
1700018B08RikQ9DA83 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
1700018B08RikQ9DA83 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
1700018B08RikQ9DA83 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
1700018B08RikQ9DA83 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
1700018B08RikQ9DA83 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
1700018B08RikQ9DA83 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
1700018B08RikQ9DA83 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
1700018B08RikQ9DA83 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
1700018B08RikQ9DA83 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
1700018B08RikQ9DA83 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
1700018B08RikQ9DA83 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
1700018B08RikQ9DA83 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
1700018B08RikQ9DA83 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700018B08RikQ9DA83 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
1700018B08RikQ9DA83 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms