Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ift43Q9DA69 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift43Q9DA69 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift43Q9DA69 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift43Q9DA69 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ift43Q9DA69 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ift43Q9DA69 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift43Q9DA69 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift43Q9DA69 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ift43Q9DA69 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ift43Q9DA69 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ift43Q9DA69 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift43Q9DA69 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift43Q9DA69 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift43Q9DA69 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift43Q9DA69 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift43Q9DA69 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ift43Q9DA69 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ift43Q9DA69 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift43Q9DA69 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift43Q9DA69 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift43Q9DA69 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ift43Q9DA69 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift43Q9DA69 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift43Q9DA69 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift43Q9DA69 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift43Q9DA69 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.4 ms