Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bpifa3Q9D9J8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bpifa3Q9D9J8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bpifa3Q9D9J8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Bpifa3Q9D9J8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bpifa3Q9D9J8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bpifa3Q9D9J8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bpifa3Q9D9J8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bpifa3Q9D9J8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bpifa3Q9D9J8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bpifa3Q9D9J8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bpifa3Q9D9J8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bpifa3Q9D9J8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bpifa3Q9D9J8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Bpifa3Q9D9J8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bpifa3Q9D9J8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Bpifa3Q9D9J8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms