Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Alkbh4Q9D8F1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh4Q9D8F1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Alkbh4Q9D8F1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkbh4Q9D8F1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Alkbh4Q9D8F1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Alkbh4Q9D8F1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh4Q9D8F1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Alkbh4Q9D8F1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Alkbh4Q9D8F1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alkbh4Q9D8F1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Alkbh4Q9D8F1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Alkbh4Q9D8F1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Alkbh4Q9D8F1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Alkbh4Q9D8F1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Alkbh4Q9D8F1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh4Q9D8F1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Alkbh4Q9D8F1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh4Q9D8F1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Alkbh4Q9D8F1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh4Q9D8F1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh4Q9D8F1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Alkbh4Q9D8F1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Alkbh4Q9D8F1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms