Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shisa5Q9D7I0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shisa5Q9D7I0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shisa5Q9D7I0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Shisa5Q9D7I0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shisa5Q9D7I0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shisa5Q9D7I0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shisa5Q9D7I0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms