Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hrct1Q9D6B9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hrct1Q9D6B9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hrct1Q9D6B9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hrct1Q9D6B9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hrct1Q9D6B9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hrct1Q9D6B9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms