Protein–RNA interactions for Protein: Q9D583

4930503E14Rik, MCG118290, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930503E14RikQ9D583 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930503E14RikQ9D583 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930503E14RikQ9D583 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930503E14RikQ9D583 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930503E14RikQ9D583 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930503E14RikQ9D583 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930503E14RikQ9D583 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930503E14RikQ9D583 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930503E14RikQ9D583 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930503E14RikQ9D583 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930503E14RikQ9D583 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930503E14RikQ9D583 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930503E14RikQ9D583 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930503E14RikQ9D583 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930503E14RikQ9D583 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4930503E14RikQ9D583 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4930503E14RikQ9D583 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
4930503E14RikQ9D583 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms