Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Stag1Q9D3E6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Stag1Q9D3E6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Stag1Q9D3E6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Stag1Q9D3E6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Stag1Q9D3E6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Stag1Q9D3E6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Stag1Q9D3E6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Stag1Q9D3E6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Stag1Q9D3E6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Stag1Q9D3E6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Stag1Q9D3E6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Stag1Q9D3E6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Stag1Q9D3E6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Stag1Q9D3E6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Stag1Q9D3E6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Stag1Q9D3E6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Stag1Q9D3E6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Stag1Q9D3E6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Stag1Q9D3E6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Stag1Q9D3E6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Stag1Q9D3E6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Stag1Q9D3E6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Stag1Q9D3E6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Stag1Q9D3E6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Stag1Q9D3E6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Stag1Q9D3E6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Stag1Q9D3E6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Stag1Q9D3E6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Stag1Q9D3E6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Stag1Q9D3E6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Stag1Q9D3E6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Stag1Q9D3E6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Stag1Q9D3E6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Stag1Q9D3E6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Stag1Q9D3E6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Stag1Q9D3E6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Stag1Q9D3E6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stag1Q9D3E6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stag1Q9D3E6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Stag1Q9D3E6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Stag1Q9D3E6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Stag1Q9D3E6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Stag1Q9D3E6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Stag1Q9D3E6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Stag1Q9D3E6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Stag1Q9D3E6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Stag1Q9D3E6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stag1Q9D3E6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stag1Q9D3E6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Stag1Q9D3E6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stag1Q9D3E6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Stag1Q9D3E6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Stag1Q9D3E6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Stag1Q9D3E6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Stag1Q9D3E6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Stag1Q9D3E6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stag1Q9D3E6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Stag1Q9D3E6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stag1Q9D3E6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms