Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dnaaf1Q9D2H9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dnaaf1Q9D2H9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dnaaf1Q9D2H9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnaaf1Q9D2H9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnaaf1Q9D2H9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Dnaaf1Q9D2H9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnaaf1Q9D2H9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnaaf1Q9D2H9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dnaaf1Q9D2H9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnaaf1Q9D2H9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnaaf1Q9D2H9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dnaaf1Q9D2H9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dnaaf1Q9D2H9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dnaaf1Q9D2H9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dnaaf1Q9D2H9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms