Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pramef12Q9D2F1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pramef12Q9D2F1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pramef12Q9D2F1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pramef12Q9D2F1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pramef12Q9D2F1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pramef12Q9D2F1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pramef12Q9D2F1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Pramef12Q9D2F1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pramef12Q9D2F1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pramef12Q9D2F1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pramef12Q9D2F1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pramef12Q9D2F1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pramef12Q9D2F1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pramef12Q9D2F1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pramef12Q9D2F1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pramef12Q9D2F1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pramef12Q9D2F1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Pramef12Q9D2F1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pramef12Q9D2F1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pramef12Q9D2F1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pramef12Q9D2F1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pramef12Q9D2F1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pramef12Q9D2F1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms