Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nde1Q9CZA6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nde1Q9CZA6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nde1Q9CZA6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nde1Q9CZA6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nde1Q9CZA6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nde1Q9CZA6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nde1Q9CZA6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nde1Q9CZA6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms