Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
3110001I22RikQ9CZ70 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
3110001I22RikQ9CZ70 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
3110001I22RikQ9CZ70 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
3110001I22RikQ9CZ70 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
3110001I22RikQ9CZ70 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
3110001I22RikQ9CZ70 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
3110001I22RikQ9CZ70 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3110001I22RikQ9CZ70 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110001I22RikQ9CZ70 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
3110001I22RikQ9CZ70 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
3110001I22RikQ9CZ70 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
3110001I22RikQ9CZ70 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms