Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins3Q9CY94 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins3Q9CY94 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gins3Q9CY94 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gins3Q9CY94 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gins3Q9CY94 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms