Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm8Q9CXT6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Kdm8Q9CXT6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kdm8Q9CXT6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm8Q9CXT6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm8Q9CXT6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kdm8Q9CXT6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm8Q9CXT6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kdm8Q9CXT6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm8Q9CXT6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Kdm8Q9CXT6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kdm8Q9CXT6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm8Q9CXT6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kdm8Q9CXT6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kdm8Q9CXT6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm8Q9CXT6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm8Q9CXT6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm8Q9CXT6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kdm8Q9CXT6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm8Q9CXT6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Kdm8Q9CXT6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm8Q9CXT6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm8Q9CXT6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm8Q9CXT6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm8Q9CXT6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm8Q9CXT6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm8Q9CXT6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm8Q9CXT6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm8Q9CXT6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm8Q9CXT6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm8Q9CXT6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm8Q9CXT6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm8Q9CXT6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm8Q9CXT6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm8Q9CXT6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm8Q9CXT6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm8Q9CXT6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm8Q9CXT6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm8Q9CXT6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm8Q9CXT6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm8Q9CXT6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm8Q9CXT6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm8Q9CXT6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm8Q9CXT6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm8Q9CXT6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm8Q9CXT6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm8Q9CXT6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm8Q9CXT6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm8Q9CXT6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm8Q9CXT6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm8Q9CXT6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm8Q9CXT6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm8Q9CXT6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm8Q9CXT6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm8Q9CXT6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm8Q9CXT6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms