Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prdm5Q9CXE0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm5Q9CXE0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm5Q9CXE0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm5Q9CXE0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm5Q9CXE0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm5Q9CXE0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm5Q9CXE0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm5Q9CXE0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm5Q9CXE0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm5Q9CXE0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prdm5Q9CXE0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prdm5Q9CXE0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm5Q9CXE0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm5Q9CXE0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm5Q9CXE0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prdm5Q9CXE0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prdm5Q9CXE0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prdm5Q9CXE0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm5Q9CXE0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prdm5Q9CXE0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prdm5Q9CXE0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prdm5Q9CXE0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prdm5Q9CXE0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prdm5Q9CXE0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms