Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc17Q9CXD9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lrrc17Q9CXD9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lrrc17Q9CXD9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lrrc17Q9CXD9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lrrc17Q9CXD9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc17Q9CXD9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc17Q9CXD9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc17Q9CXD9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lrrc17Q9CXD9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc17Q9CXD9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc17Q9CXD9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc17Q9CXD9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc17Q9CXD9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc17Q9CXD9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc17Q9CXD9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc17Q9CXD9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc17Q9CXD9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc17Q9CXD9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc17Q9CXD9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc17Q9CXD9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc17Q9CXD9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc17Q9CXD9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc17Q9CXD9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc17Q9CXD9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc17Q9CXD9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc17Q9CXD9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc17Q9CXD9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc17Q9CXD9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc17Q9CXD9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc17Q9CXD9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc17Q9CXD9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc17Q9CXD9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc17Q9CXD9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc17Q9CXD9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc17Q9CXD9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc17Q9CXD9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc17Q9CXD9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc17Q9CXD9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc17Q9CXD9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc17Q9CXD9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc17Q9CXD9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms