Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Dis3Q9CSH3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Dis3Q9CSH3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dis3Q9CSH3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Dis3Q9CSH3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Dis3Q9CSH3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Dis3Q9CSH3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dis3Q9CSH3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Dis3Q9CSH3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dis3Q9CSH3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dis3Q9CSH3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dis3Q9CSH3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dis3Q9CSH3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dis3Q9CSH3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dis3Q9CSH3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Dis3Q9CSH3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dis3Q9CSH3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dis3Q9CSH3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dis3Q9CSH3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dis3Q9CSH3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dis3Q9CSH3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dis3Q9CSH3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Dis3Q9CSH3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dis3Q9CSH3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dis3Q9CSH3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dis3Q9CSH3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dis3Q9CSH3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dis3Q9CSH3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dis3Q9CSH3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dis3Q9CSH3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dis3Q9CSH3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dis3Q9CSH3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dis3Q9CSH3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dis3Q9CSH3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dis3Q9CSH3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dis3Q9CSH3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dis3Q9CSH3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Dis3Q9CSH3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Dis3Q9CSH3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Dis3Q9CSH3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dis3Q9CSH3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dis3Q9CSH3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dis3Q9CSH3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dis3Q9CSH3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dis3Q9CSH3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dis3Q9CSH3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Dis3Q9CSH3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dis3Q9CSH3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Dis3Q9CSH3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Dis3Q9CSH3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Dis3Q9CSH3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dis3Q9CSH3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Dis3Q9CSH3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Dis3Q9CSH3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Dis3Q9CSH3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Dis3Q9CSH3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dis3Q9CSH3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Dis3Q9CSH3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Dis3Q9CSH3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dis3Q9CSH3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Dis3Q9CSH3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Dis3Q9CSH3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Dis3Q9CSH3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dis3Q9CSH3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Dis3Q9CSH3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Dis3Q9CSH3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dis3Q9CSH3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms