Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nrxn1Q9CS84 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Nrxn1Q9CS84 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Nrxn1Q9CS84 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Nrxn1Q9CS84 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nrxn1Q9CS84 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nrxn1Q9CS84 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nrxn1Q9CS84 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nrxn1Q9CS84 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nrxn1Q9CS84 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nrxn1Q9CS84 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Nrxn1Q9CS84 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Nrxn1Q9CS84 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Nrxn1Q9CS84 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Nrxn1Q9CS84 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nrxn1Q9CS84 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Nrxn1Q9CS84 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nrxn1Q9CS84 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nrxn1Q9CS84 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nrxn1Q9CS84 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nrxn1Q9CS84 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Nrxn1Q9CS84 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nrxn1Q9CS84 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Nrxn1Q9CS84 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Nrxn1Q9CS84 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nrxn1Q9CS84 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nrxn1Q9CS84 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nrxn1Q9CS84 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Nrxn1Q9CS84 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nrxn1Q9CS84 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Nrxn1Q9CS84 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nrxn1Q9CS84 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Nrxn1Q9CS84 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Nrxn1Q9CS84 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nrxn1Q9CS84 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Nrxn1Q9CS84 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nrxn1Q9CS84 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nrxn1Q9CS84 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Nrxn1Q9CS84 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nrxn1Q9CS84 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nrxn1Q9CS84 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Nrxn1Q9CS84 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Nrxn1Q9CS84 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nrxn1Q9CS84 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nrxn1Q9CS84 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nrxn1Q9CS84 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Nrxn1Q9CS84 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nrxn1Q9CS84 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nrxn1Q9CS84 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.79■■■■□ 3
Nrxn1Q9CS84 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Nrxn1Q9CS84 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Nrxn1Q9CS84 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Nrxn1Q9CS84 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nrxn1Q9CS84 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nrxn1Q9CS84 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Nrxn1Q9CS84 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Nrxn1Q9CS84 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms