Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CactinQ9CS00 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CactinQ9CS00 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CactinQ9CS00 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CactinQ9CS00 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CactinQ9CS00 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CactinQ9CS00 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CactinQ9CS00 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CactinQ9CS00 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CactinQ9CS00 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CactinQ9CS00 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CactinQ9CS00 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CactinQ9CS00 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CactinQ9CS00 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CactinQ9CS00 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CactinQ9CS00 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CactinQ9CS00 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CactinQ9CS00 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CactinQ9CS00 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CactinQ9CS00 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CactinQ9CS00 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CactinQ9CS00 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CactinQ9CS00 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CactinQ9CS00 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms