Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd1Q9CRY7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd1Q9CRY7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdpd1Q9CRY7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gdpd1Q9CRY7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdpd1Q9CRY7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdpd1Q9CRY7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdpd1Q9CRY7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms