Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI4

Nwc, Uncharacterized protein C11orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NwcQ9CQI4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NwcQ9CQI4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NwcQ9CQI4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NwcQ9CQI4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NwcQ9CQI4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NwcQ9CQI4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NwcQ9CQI4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NwcQ9CQI4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NwcQ9CQI4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NwcQ9CQI4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NwcQ9CQI4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NwcQ9CQI4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NwcQ9CQI4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NwcQ9CQI4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NwcQ9CQI4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NwcQ9CQI4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms