Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39lQ9CQD0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39lQ9CQD0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39lQ9CQD0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39lQ9CQD0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl39lQ9CQD0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl39lQ9CQD0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl39lQ9CQD0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl39lQ9CQD0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpl39lQ9CQD0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl39lQ9CQD0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rpl39lQ9CQD0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl39lQ9CQD0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rpl39lQ9CQD0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl39lQ9CQD0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rpl39lQ9CQD0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl39lQ9CQD0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rpl39lQ9CQD0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl39lQ9CQD0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl39lQ9CQD0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl39lQ9CQD0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rpl39lQ9CQD0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl39lQ9CQD0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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