Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trpd52l3Q9CQ14 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpd52l3Q9CQ14 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpd52l3Q9CQ14 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpd52l3Q9CQ14 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpd52l3Q9CQ14 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpd52l3Q9CQ14 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms