Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Bhlhe41Q99PV5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bhlhe41Q99PV5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bhlhe41Q99PV5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bhlhe41Q99PV5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bhlhe41Q99PV5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms