Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3b1Q99NB9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b1Q99NB9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b1Q99NB9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b1Q99NB9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3b1Q99NB9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b1Q99NB9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b1Q99NB9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b1Q99NB9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b1Q99NB9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b1Q99NB9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sf3b1Q99NB9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b1Q99NB9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b1Q99NB9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b1Q99NB9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Sf3b1Q99NB9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b1Q99NB9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b1Q99NB9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b1Q99NB9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b1Q99NB9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b1Q99NB9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b1Q99NB9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sf3b1Q99NB9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b1Q99NB9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b1Q99NB9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Sf3b1Q99NB9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b1Q99NB9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sf3b1Q99NB9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sf3b1Q99NB9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sf3b1Q99NB9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms