Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GsdmcQ99NB5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GsdmcQ99NB5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GsdmcQ99NB5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GsdmcQ99NB5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GsdmcQ99NB5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GsdmcQ99NB5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GsdmcQ99NB5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms